江南中科院海洋所发现基因组内简单重复序列在对虾适应性进化中的关键作用—新闻—科学网
时间：2023-11-11 14:03:10 已阅读:77次
3月9日，记者从中国科学院海洋研究所获悉，由该所李富花课题组主导完成的科研论文《简朴反复序列促成对于虾基因组可塑性以及顺应性进化》于Nature子刊《通信-生物学》（《Co妹妹unications Biology》）于线揭晓。该研究结果为阐明生物体内SSR的功效以及甲壳植物对于情况的顺应进化研究提供了新的线索，也为对于虾基因组育种以及份子改善提供了主要的理论根蒂根基以及数据支撑。
中科院海洋所袁剑波副研究员以及张晓军研究员、南开年夜学王敏传授为文章配合第一作者。中科院海洋所李富花研究员以及相建海研究员、南开年夜学冯露传授为文章通信作者。 该研究针对于简朴反复序列（simple sequence repeat, SSR）于对于虾基因组内呈发作式扩张的征象，初次提出SSR于基因组内连忙扩张的新机制，展现了SSR于对于虾基因组的可塑性以及顺应性进化历程中的要害作用。李富花先容，SSR是由1-6个碱基串联反复屡次造成，于所有已经测基因组物种中含量遍及较低（仅约1%摆布），并且它们凡是被以为是没有功效的，属在基因组上的 垃圾DNA 。然而，该课题组前期研究发明凡纳滨对于虾基因组SSR含量竟高达23.93%，激发了研究职员对于在SSR于对于虾进化中的功效及作用机制的稠密乐趣。 李富华暗示，为了探究SSR的漫衍特性以及功效，研究职员完成为了另外一种对于虾 中国明对于虾的全基因组测序以及拆卸，并基在Hi-C测序，构建了凡纳滨对于虾以及中国明对于虾染色体程度的基因组图谱。经由过程比力基因组学阐发，揣度SSR的发作式扩张发生于对于虾的先人基因组上，而SSR的特同性扩张也呈现于差别对于虾分解以后。SSR的扩张事务也与生物年夜灭尽事务后对于虾的倏地进化时间一致，提醒了SSR于对于虾顺应性进化历程中的要害作用。 李富华说，本研究初次发明SSR发作式扩张的新机制，与传统以为的复制滑动突变模子差别，研究职员发明对于虾SSR的发作式扩张重要与转座元件的携带有关，并进一步鉴定出近期活跃的转座元件，揣度其仍具备携带SSR扩张的潜能。本研究发明SSR于对于虾基因组可塑性以及情况顺应中具备主����APP要作用，高密度的SSR漫衍惹起对于虾染色体内年夜范围基因组重排。 只管中国明对于虾以及凡纳滨对于虾亲缘瓜葛邻近，可是它们于盐度顺应威力上却存于显著差异。研究职员初次发明对于虾重要经由过程调控体内自由氨基酸的含量来调治体内的渗入压，而SSR能富集在基因调控区，介入渗入压调治要害通路的基因表达调控。这些基因表达模式的差异多是惹起两种对于虾渗入压调控威力差异的主要缘故原由。出格声明：本文转载仅仅是出在流传信息的需要，其实不象征着代表本消息网不雅点或者证明其内容的真实性；如其他媒体、消息网或者小我私家从本消息网转载使用，须保留本消息网注明的“来历”，并自大版权等法令义务；作者假如不但愿被转载或者者接洽转载稿费等事宜，请与咱们联系。/江南